potresti mettere gli oggetti che ti servono dentro un update panel e tramite il timer collegato a quest'ultimo far partire l'evento che ti serve aggiornando così solo il contenuto dell'update panel.
Per farti un'esempio io ho una pagina con una gridview che va aggiornata ogni minuto, per evitare di aggiornare tutta la pagina ho inserito la gridview nel upddate panel piu o meno in questo modo
spreo di essere stato chiaro